AutoDock使用问题:AutoDock中配体原子数是否存在限制?

在AutoDock中配体分子的大小是否有限制?

在AutoDock中配体分子的原子数量是有限制的。默认情况下,原子的最大数目是2048。

此限制是在源文件“constants.h”中指定的,对应的参数项为“MAX_ATOMS”。如下所示

此文件在路径“autodocksuite-4.x.x/src/autodock-4.0.1/constants.h”下。

该变此参数项即可修改原子数量上限,但是若要修改此参数,需要确保“MAX_RECORDS”项的值和你设置的原子最大数目相同。