魔德科技案例:分子模拟方法解释肌冠蛋白的酚修饰对其结构的影响

合作单位:Nanjing Agricultural University

参考文献:Jiahui Chen, Xing Zhang, Xing Chen, et al. Food Chemistry, 2022. DOI:10.1016/j.foodchem.2022.132662(IF = 9.23)

背景:

肌冠蛋白 (MPN)是一种应用广泛的肉类蛋白,因其结构灵活可调而备受关注。MPN的酚修饰可以明显改善其物理化学特性,是肉类加工中的一项重要技术。使用多酚(PPs)修饰MPN,可以制造具有理想物理化学性能的产品。因此,PPs在MPN上的共价修饰是有意义的。

一般通过酶催化、自由基接枝和碱性反应三种方法可获得MPN-PP偶联物。然而,自由基接枝由于过氧化氢的使用使其在食品中的应用受到限制。与价格昂贵的酶催化法相比,碱性反应是PPs与蛋白质形成偶联物的最优选。然而,应用碱性反应后,共轭物的最终接枝效果和功能性质却不尽人意。PPs在碱性反应过程中容易诱导蛋白质交联的形成,这些化合物可能逐渐聚合甚至形成沉淀,从而降低了偶联物的最终质量。此外,MPN原有的致密结构可以阻止活性氨基酸参与酚类修饰。因此,提高碱性条件下MPN的改性效果是极具挑战性的。

近年来,超声(UT)被认为是一种促进共价反应的增强方法,其处理时间更短,可以加速疏水性基团的暴露,增加蛋白质的灵活性。因此,可以利用UT进一步增强MPN在碱性条件下的修饰效果。

然而,迄今为止,关于利用UT和PPs修饰MPN的研究很少。在食品科学中,主要的挑战是将MPN-PP偶联物的物理化学性质与实验PPs的化学结构联系起来。因此,本文研究了三种结构相关的多酚,表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)、表没食子儿茶素(EGC)、表儿茶素(EC)和MPN在常规碱性反应和超声辅助氧化体系中的接枝反应,旨在探讨三种结构相关的酚类化合物对MPN结构和理化性质的影响。

方案设计:

鉴于实验方法,在微观尺度上,MPN-EGCG的孔面积发生了明显的变化。为进一步分析UT辅助共价接枝后PP在MPN上的作用机理,经与魔德科技(www.modekeji.cn)技术团队沟通,拟通过分子模拟方法对其进行研究。

主要结果:

从图1(A、B)可以看出,EGCG的C环和D环都像“钳子”一样粘在MPN的α-螺旋结构上,以达到更好的形状匹配。此外,由于该PP的位阻作用,EGCG的A环和B环面向外,而其C环和D环更靠近MPN。根据最优能量原理,D环与MPN的疏水部分结合,EGCG中的羟基部分也可以与周围的亲水性氨基酸相互作用。关于UT辅助共价反应后MPN与EGCG分子相互作用的三维结合模式如图1(C)。可以观察到,在UT辅助反应后,EGCG仍然保留了“多重自由裁量权”结构和位阻特征,从而有助于化合物与其他活性基团之间的最佳相互作用。这一结果与前面讨论中得到的改进的结构性能是一致的。此外,三维结合模式揭示了EGCG D环上独特的非共价相互作用,包括氢键和强疏水相互作用。可以得出结论,氢键和疏水相互作用可能是UT辅助反应后D环独特效应的主要驱动力,这一特性提高EGCG了的稳定性。

图1 超声辅助EGCG修饰MPN的对接结果(A)、相应的放大图像(B)和三维结合模式(C)(EGCG为棒状模型,蓝色和橙色区域分别代表MPN的亲水性和疏水性区域)。

结论:

EGCG通过其独特的D环结构有效地改变了MPN的构象。通过UT,MPN的结构特性被EGCG中D环结构的非共价相互作用显著改变。因此,UT辅助EGCG接枝组结构最为稳定。