同源建模

同源模建(Homology Modeling)根据模板蛋白,预测目标蛋白的三维结构。对于尚未或者无法获得实验晶体结构的蛋白质,同源模建无疑是一种重要而有效的辅助手段。构建的蛋白模型也可用于后续分子机制的探索。

步骤流程

序列搜索和比对,获得同源蛋白序列和结构;结构比对,构建目标蛋白三维结构;利用分子力学方法进行结构优化;评价蛋白模型的可靠性。