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日志 wyd

博客文章

如何准备AutoDock 4受体文件

本文将详细描述如何使用python脚本“prepare_recrptor4.py”生成AutoDock 4的受 […]

2019年8月27日 通过: wyd
博客文章

AutoDockTools使用教程下载

AutoDockTools是为了能让用户更方便地使用AutoDock而开发的带图形用户界面的配套软件。使用AutoDockTools,用户可以免去输入Unix命令的麻烦,快速上手操作AutoDock。

2019年8月27日 通过: wyd
博客文章

AutoDock PDBQT文件详解

PDBQT文件 AutoGrid使用PDBQS文件来存储受体,PDBQS中包含了大分子所有原子的坐标、部分电荷 […]

2019年8月26日 通过: wyd
博客文章

在AutoDock中设置使用脚本程序

本教程讲解如何配置Python解释器,以便其能在MGLTools中找到资源包。本指南适用于使用MGLTools附带的Python解释器的用户。

2019年8月23日 通过: wyd
博客文章

如何准备AutoDock 4 配体文件

如何在AutoDock中准备配体文件?本教程将讲解如何用python脚本(prepare_ligand4.py)生成AutoDock所需的配体文件。

2019年8月23日 通过: wyd
博客文章

AutoDock虚拟筛选

虚拟筛选,即使用高性能的计算机分析大型化合物数据库以得到潜在的先导物 。如何使用AutoDock进行虚拟筛选?

2019年8月22日 通过: wyd
博客文章

AutoDock在ADT中如何移动配体

如何才能在ADT/PMV中,单独地移动配体的位置呢? 第一步:在状态栏中找到并单击DejaVu按钮 第二步:在 […]

2019年8月21日 通过: wyd
博客文章

如何在AutoDock中添加新的原子参数

由于缺少实验数据,所以在AutoDock中有些原子,比如重金属离子,是没有写进AutoDock的标准力场文件中 […]

2019年8月20日 通过: wyd
博客文章

非平衡分子动力学模拟

对体系添加较小的扰动,假设体系热力学量与此扰动成线性关系,进而获得体系热力学量的方法是平衡分子动力学模拟的基础 […]

2019年8月19日 通过: wyd
博客文章

AutoDock 结果分析——保存蛋白质—配体复合物

如何蛋白质——配体复合物保存在PDB文件中? 在完成配体与蛋白质的对接后,该如何将蛋白质——配体复合物保存在P […]

2019年8月16日 通过: wyd
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