PMH与LpxC的分子识别及3D-QSAR模型

背景 内毒素脂质A(LA)的合成共有9个酶参与, 其中由LpxC基因编码的UDP-3-O-(R-羟基十四酰)-N-乙酰氨基葡糖脱乙酰酶(LpxC)催化的脱乙酰反应是整个生物合成途径中的首个关键步骤,有效抑制LpxC能干扰LPS的合成,最终导致菌体细胞的死亡。另外,…

抗菌酶LpxC与小分子的作用机理研究

背景 内毒素脂质A(lipid A,LA)作为G-菌脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)嵌合于外膜上的“ 锚”, 其生物合成对于G-菌外膜组装至关重要。LA的合成共有9个酶参与, 其中由LpxC基因编码的UDP-3-O-(R-羟基十四酰)-N-乙酰氨基葡糖脱乙酰酶(LpxC)催化的脱乙酰反应是整个生物合成途径中的首个关键步骤,有效抑制LpxC能干扰LPS的合成,最终导致菌体细胞的死亡。另外,…

HCV NS3/4A 蛋白酶与FAM的识别及分子设计基础研究

背景 HCV NS3/4A 蛋白酶 (Protease,PR) 是由NS3丝氨酸蛋白与辅助因子NS4A 蛋白以非共价键结合而成的二聚体。NS3 丝氨酸PR 是HCV非结构蛋白加工成熟过程的关键酶,与三磷酸核苷酸酶、RNA 解螺旋酶结合,构成HCV…

泛素化途径中Skp2蛋白的作用机理研究

背景 泛素依赖性降解途径( ubiquitin dependent degradation pathway,UDDP) 可降解细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子( cyclin dependent kinase inhibitor,CKI) ,其在癌细胞中的异常表达是癌细胞无限生长的主要原因之一.…

HIV IN与DKAs的分子模拟研究

背景 目前,全球流行的主要是HIV-1 病毒。HIV-1 的基因可以编码3 种酶: 逆转录酶( reverse transcriptase, RT) 、整合酶( integrase, IN)和蛋白酶( protease, PR) 。其中IN 是一个由288 个氨基酸残基组成的蛋白,折叠成3…

提高Pt(Ⅱ)配合物磷光量子产率的研究

背景 Pt(Ⅱ)配合物作为磷光材料在OLED领域具有巨大的发展潜力。研究表明,π共轭的增强不仅能使辐射速率常数增大,还有利于电荷的转移。 目的 深入探究增强配体π共轭与磷光量子产率之间的关系 研究结果 磷光是电子在处于不同自旋多重度间跃迁产生的一种发光现象,可由光吸收、电流和化学反应引起。如图1所示,当处于基态的分子吸收光能、电能或化学能后,电子受到激发。电子被激发到Sn态,Sn态电子可以失活回到S1态,也可以从单重激发态向三重激发态Tn跃迁,此时电子的自旋发生反转,处于Tn态的电子可以失活至T1激发态。若电子从S1态光淬灭到基态,产生的光辐射为荧光;若电子从T1态光淬灭至基态,产生的光辐射为磷光。但是,电子从激发态回到基态所释放的能量并非都是通过光辐射,还有非辐射途径,因此量子产率可以用来表示某一光化学或光物理过程中,被吸收的光子利用效率。 图1…

分子对接分析报告

项目说明 采用分子对接技术研究配体分子tak-285与EGFR激酶的结合模式。 计算方法 从RCSB Protein Data Bank(http://www.rcsb.org)下载EGFR的X-ray晶体 结构(PDB 编号:3POZ),分辨率为1.5 Å。采用UCSF…