四川魔德科技有限公司
  • 首页
  • 公司新闻
  • 技术服务
  • 产品
    • 硬件产品
    • 软件开发及代理
    • 虚拟分子库
    • GPU云计算服务器
  • 成功案例
  • 资源中心
  • 关于我们
    • 公司介绍
    • 招贤纳士
    • 联系我们
  • 常见问题
  • 自助询价
  • Search
  • Menu
  • Mail

虚拟筛选中的分子对接

博客文章

21世纪以来,随着药物研究的新方法和新技术的发展,大量蛋白质的三维结构被解析出来,大量的靶标蛋白被选做为潜在的治疗靶标进行研究,极大地拓展了分子对接及虚拟筛选方法在药物设计开发中的应用范围。

分子对接方法是基于受体结构的虚拟筛选方法,主要是采用计算机技术来模拟小分子配体与受体之间的结合。分子对接方法能够大量节省药物研究的成本,并且可以有效缩短研发周期。

1、虚拟筛选的意义

虚拟筛选是基于靶点蛋白的三维结构或定量构效关系模型,在已知的小分子数据库中挑选出符合要求的化合物,进而针对特定疾病进行治疗的一种实验方法。虚拟筛选的目标是在已有的分子库中挑选出新的先导化合物,减少化合物的备选数量。

2、虚拟筛选的流程

虚拟筛选的流程主要包括:

  1. 准备化合物数据库
  2. 根据受体结构是否已知,选择合适的虚拟筛选方法
  3. 基于配体的虚拟筛选方法,根据定量构效关系模型或药效团模型进行筛选;若基于受体的虚拟筛选,则根据受体的三维结构进行筛选;
  4. 对筛选的结果进行生物实验测试
  5. 对候选化合物进行临床研究,确定能否作为新药化合物

3、分子对接

分子对接旨在搜寻小分子与蛋白的相互作用位点,使二者结合形成地能构象。分子对接包括三个部分,结合位点的识别,构象搜索算法和打分函数。

分子对接的软件有很多种,包括Autodock、DOCK、FlexX和GOLD等,他们之间的关系如下表所示

4、基于分子对接的虚拟筛选

分子对接技术是基于受体结构进行药物设计的重要方法,也是创新开发药物的重要手段。分子对接是虚拟筛选的核心技术,可以大大减小药物的筛选数量,缩短研发周期。2002年,Gruneberg等通过分子对接虚拟筛选,成功筛选出几种碳酸酐酶抑制剂,抑制活性达到微摩尔水平。

2020年3月13日/0 评论/通过: wyd
标签: 分子对接, 虚拟筛选, 虚拟筛选流程
Share this entry
  • Share by Mail
http://www.modekeji.cn/wp-content/uploads/2018/09/modeweblogo-300x99.png 0 0 wyd http://www.modekeji.cn/wp-content/uploads/2018/09/modeweblogo-300x99.png wyd2020-03-13 17:18:332020-03-13 17:20:33虚拟筛选中的分子对接
0 回复

发表评论

Want to join the discussion?
Feel free to contribute!

发表评论 取消回复

电子邮件地址不会被公开。 必填项已用*标注

近期文章

  • 短链脱氢酶催化合成奥利司他中间体的机制研究
  • 一种新型N-酰基高丝氨酸内酯合酶底物特异性结构研究
  • 分子模拟在荧光传感平台中的应用——主客体相互作用研究
  • 虚拟筛选中的分子对接
  • YASARA软件完整功能介绍
  • 四川魔德科技有限公司成功取得YASARA中国代理权
  • AutoDock:当我可视化一个已对接化合物时,该注意些什么?
  • AutoDock使用问题:AutoDock中配体原子数是否存在限制?
  • AtoDock最新版4.2.6分子对接教程用户指南下载
  • AUTODOCK 4 获得对接结果摘要
2021年三月
一 二 三 四 五 六 日
« 4月    
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
293031  

标签

YASARA 一键分子动力学模拟 主客体相互作用 催化机制 催化活性 分子动力学 分子对接 分子模拟 分子模拟综合软件 分子模拟软件 分子识别 可视化分子模拟 同源建模 简单分子对接 虚拟筛选 虚拟筛选流程 蛋白突变 金属蛋白处理

四川魔德科技有限公司

我们以专业的态度做适用的解决方案,致力于成为分子模拟技术行业优秀的服务商。 魔德科技拥有一套完整的从分子模拟研究到化学合成、活性测试的先导分子实验室,具有将虚拟分子转化为先导分子的能力,可以大大提升分子设计和开发效率。

  • 电话

    028-87579279

  • 邮件

    modekeji@modekeji.cn

  • 地址

    四川省成都市高新区玉林西路143号

点击这里给我发消息

扫码添加微信

Copyright © 2018 四川魔德科技有限公司 版权所有 modekeji.cn保留一切权利 | 蜀ICP备18012326号-1 | 

YASARA软件完整功能介绍 分子模拟在荧光传感平台中的应用——主客体相互作用研...
Scroll to top